لم يكن الامام جعفر الصادق (ع) مجتهداً ولا صاحب رأي اجتهادي، بل كان مواصلاً لسيرة الرسالة وحاملاً لآثار أهل البيت (ع) ، فمنها يغترف وبها يُفتي المسلمين ، وعليها يعتمد ، فكانت مدرسته ومنهجه امتداداً للسنّة النبويّة ، وكشفاً عن محتوى الوحي القرآني ، وإظهاراً لمضمونه .
والّذي يتابع منهج الامام ، ومهمّته العلميّة يكتشف أنّ الامام كان يستهدف بعمله ومدرسته الأهداف الآتية :